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原標題:AlphaFold 預測細菌生存所需的 1402 種蛋白互作,最完整的細菌必需相互作用圖譜
關鍵字:蛋白質,細菌,研究人員,復合物,結構
文章來源:人工智能學家
內容字數:5115字
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新鮮的 AI for Science 資訊革蘭氏陰性必需相互作用組。(來源:eLife)
編輯 | 紫羅
細菌蛋白質組平均由約 4000-5000 個蛋白質組成,這意味著相互作用組可能多達 2000 萬個相互作用。
據估計,大腸桿菌中大約有 12,000 種物理相互作用。然而,并非所有這些相互作用都對細菌的生存至關重要。
對生物體中蛋白質相互作用的研究,是理解生物過程和中心代謝途徑的基礎。然而,我們對細菌相互作用組的了解仍然有限。
近日,西班牙巴塞羅那自治大學(Universitat Autònoma de Barcelona,UAB)的研究人員使用人工智能工具 AlphaFold,預測并模擬了細菌中必需(essential)蛋白質之間的 1402 種相互作用。
研究人員繪制了最完整的細菌必需相互作用圖譜,即蛋白質如何結合和相互作用以執行其生存所必需的功能。
這些結果揭示了這些機制以前未知的細節,并為開發新的抗生素提供了潛在的靶點。
該研究以《Structural assembly of the bacterial essential in
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