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原標題:AI小分子藥物發現的「百科全書」,康奈爾、劍橋、EPFL等研究者綜述登Nature子刊
關鍵字:分子,模型,藥物,報告,表示
文章來源:機器之心
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新鮮的 AI for Science 資訊作者|康奈爾大學杜沅豈
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隨著 AI for Science 受到越來越多的關注,人們更加關心 AI 如何解決一系列科學問題并且可以被成功借鑒到其他相近的領域。
AI 與小分子藥物發現是其中一個非常有代表性和很早被探索的領域。分子發現是一個非常困難的組合優化問題(由于分子結構的離散性)并且搜索空間非常龐大與崎嶇,同時驗證搜索到的分子屬性又十分困難,通常需要昂貴的實驗,至少是至少是模擬計算、量子化學的方法來提供反饋。
隨著機器學習的高速發展和得益于早期的探索(包括構建了簡單可用的優化目標與效果衡量方法),大量的算法被研發,包括組合優化,搜索,采樣算法(遺傳算法、蒙特卡洛樹搜索、強化學習、生成流模型/GFlowNet,馬爾可夫鏈蒙特卡洛等),與連續優化算法,貝葉斯優化,基于梯度的優化等。同時現有較為完備的算法衡量基準,比較客觀公平的比較方式,也為開發機器學習算法開拓了廣闊的空間。
近日,康奈爾大學、劍橋大學和洛桑聯邦理工學院(EPFL)的研究人員在《Nature Machin
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