国产精品亚洲mnbav网站_成人午夜亚洲精品无码网站_日韩va亚洲va欧洲va国产_亚洲欧洲精品成人久久曰影片

EGO官網(wǎng)入口網(wǎng)址，模擬蛋白質(zhì)的并行分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算程序

SPAdes官網(wǎng)入口網(wǎng)址，可以拼接來自多個(gè)平臺(tái)的測序數(shù)據(jù)

TopHat官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一個(gè)快速的將RNA-Seq數(shù)據(jù)進(jìn)行快速剪接映射的程序

NovoAlign官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一款商業(yè)軟件,但是如果只是科研用途的話,可以直接從其網(wǎng)站上下載到編譯好的程序

HISAT2官網(wǎng)入口網(wǎng)址，是一種快速靈敏的比對(duì)程序，用于將下一代測序讀數(shù)（包括DNA和RNA）映射到人類基因組群體（以及單個(gè)參考基因組）

Megahit官網(wǎng)入口網(wǎng)址，用于大型和復(fù)雜宏基因組學(xué)NGS讀取的單節(jié)點(diǎn)匯編程序，例如土壤

Phylip官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一款很經(jīng)典的構(gòu)建進(jìn)化樹的軟件

MrBayes官網(wǎng)入口網(wǎng)址，使用貝葉斯方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹

PAML官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一款利用最大似然法對(duì)DNA或蛋白質(zhì)序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析的軟件包

GenomeComp官網(wǎng)入口網(wǎng)址，中科院生物物理所生物信息實(shí)驗(yàn)室推出的可視化的微生物基因組比較工具

Velvet官網(wǎng)入口網(wǎng)址，用于拼接短序列組裝

ABySS官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一個(gè)短序列的從頭拼接軟件

Bowtie官網(wǎng)入口網(wǎng)址，超級(jí)快速的,較為節(jié)省內(nèi)存的短序列拼接至模板基因組的工具

NAMD官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一套廣為應(yīng)用的并行分子動(dòng)力學(xué)模擬軟件，是主要用來研究大分子體系的高性能分子模擬軟件

MUMmer官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一個(gè)快速比對(duì)兩個(gè)基因組序列的軟件

T-Coffee官網(wǎng)入口網(wǎng)址，準(zhǔn)確度和強(qiáng)大的功能，能夠整合很多信息,如結(jié)構(gòu)信息,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)等用于序列比對(duì)

SAMtools官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一套與高通量測序數(shù)據(jù)交互的程序

InterProScan官網(wǎng)入口網(wǎng)址，通過蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域和功能位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫預(yù)測蛋白質(zhì)功能

ClustalW-MPI官網(wǎng)入口網(wǎng)址，并行ClustalW

ClustalW2官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一種漸進(jìn)的多序列比對(duì)方法,先將多個(gè)序列兩兩比對(duì)構(gòu)建距離矩陣,反應(yīng)序列之間兩兩關(guān)系

GROMACS官網(wǎng)入口網(wǎng)址，用于研究生物分子體系的分子動(dòng)力學(xué)程序包

HMMER官網(wǎng)入口網(wǎng)址，基于隱馬爾可夫模型,用于生物序列分析工作的一個(gè)非常強(qiáng)大的軟件包,它的一般用途是識(shí)別同源蛋白或核苷酸序列和進(jìn)行序列比對(duì)

EMBOSS官網(wǎng)入口網(wǎng)址，歐洲分子生物學(xué)開放軟件包,一個(gè)開源的序列分析軟件包

mpiBLAST官網(wǎng)入口網(wǎng)址，NCBI BLAST的免費(fèi)開源并行實(shí)現(xiàn)。通過數(shù)據(jù)庫碎片，查詢分段，智能調(diào)度和并行I/O有效利用分布式計(jì)算資源，mpiBLAST將NCBI BLAST性能提高了幾個(gè)數(shù)量級(jí)，同時(shí)擴(kuò)展到數(shù)百個(gè)處理器。

通過搜索蛋白質(zhì)或DNA數(shù)據(jù)庫，或通過識(shí)別序列中的局部重復(fù)，找到蛋白質(zhì)或DNA序列之間的局部或全局相似性區(qū)域

分子動(dòng)力學(xué)相關(guān)的一些計(jì)算和模擬工作

序列組裝程序