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原標題：復旦腦科學研究院新成果：借鑒語義分割，開發空間轉錄組語義注釋工具 Pianno
關鍵字：轉錄,空間,注釋,數據,基因
文章來源：HyperAI超神經
內容字數：9433字

內容摘要：

作者：哇塞
編輯：李寶珠，三羊
復旦大學腦科學研究院諸穎團隊提出了「空間轉錄組語義注釋」概念，并開發了空間轉錄組語義注釋工具 Pianno，能夠為組織內的空間點自動定義結構或細胞類型，從而結合來自多個維度的信息，加強對復雜生物系統的解釋。自 2020 年被 Nature Methods 評選為年度技術以來，「空間轉錄組學」已成為當今生命科學領域最炙手可熱的性技術之一。簡單來說，該技術能夠獲取組織空間信息和轉錄組數據，從時間和空間維度精準解析組織內基因表達模式，以及細胞類群的空間位置關系等生物學特征，在疾病研究、生長發育、器官結構和物種演化等領域的研究中均具有極高價值。
隨著空間轉錄組學在學術科研領域持續火爆，如 10x Visium、Slide-seq 以及 Stereo-seq 等空間轉錄組學技術也如泉涌而出，這些最新成果和進展正徹底地改變人類對組織內基因表達模式的研究。然而，僅僅獲得組織內特定物理坐標的基因表達譜，還無法全面了解生物系統的復雜性，窮究其理，必須辨別組織內每個空間點的生物學身份。
目前，基于機器學習的方法已被廣泛應用于識別空間點的群集，并使用標記基因解釋其生物學身

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