推理速度很快，數小時完成數千次分子結構預測

原標題：首個國產版AlphaFold3發布！大分子預測精度超車，在線平臺即開即用，推理成本更是白菜價
文章來源：量子位
內容字數：5284字

百度HelixFold3：國產AlphaFold3強力競爭者，賦能生命科學

本文總結了百度智能云與百度螺旋槳團隊發布的HelixFold3，一款對標AlphaFold3的國產生物分子結構預測模型。HelixFold3在性能、易用性和成本方面都展現出顯著優勢，有望加速生命科學領域的發展。

1. 性能媲美甚至超越AlphaFold3

   HelixFold3在常規生物分子結構預測任務中達到了與AlphaFold3媲美的水平，尤其在RNA分子和共價修飾場景中，其精度甚至實現了大幅超越。在抗原-抗體結構預測任務中，成功率提升至80%以上，具備研究抗體結合機制的潛力。這表明HelixFold3不僅在技術上實現了突破，也具備強大的應用屬性。

2. 低門檻在線服務，簡化使用流程

   不同于AlphaFold3較高的使用門檻，HelixFold3提供在線服務，用戶無需代碼操作，只需簡單開通并按算力付費，即可輕松使用。平臺支持可視化呈現，并支持大分子（蛋白質、DNA和RNA）的任意側鏈修飾，極大地方便了用戶操作。相比AlphaFold3僅支持46種預定義修飾，HelixFold3通過SMILES定義側鏈修飾，覆蓋PDB數據庫中超過50%的修飾場景，擴展了研究空間。

3. 大幅降低推理成本，提升研究效率

   HelixFold3利用百度智能云CHPC平臺，優化了MSA檢索與模型推理，大幅降低了推理成本。例如，一條500長度的蛋白推理僅需4元，相比傳統方法降低了數個數量級。這使得高通量生物信息學應用成為可能，顯著提高了從業者的研究速率。 HelixFold3還支持API調用，方便批量推理和大規模分析。

4. 加速藥物研發，賦能生命科學

   HelixFold3的低門檻和高性能，能夠加速藥物研發流程。通過計算輔助篩選候選分子，可以大幅縮短研發周期，降低成本。目前，HelixFold3已與一些科研機構和藥企合作，驗證其在實際應用中的潛力。它有望突破藥物研發中的“雙十困境”（研發需10年，耗資10億美元），加速新藥研發進程。

5. 推動生命科學領域發展，吸引跨學科人才

   HelixFold3的出現，標志著大模型在生命科學領域的應用邁向新階段。它不僅解決了行業痛點，例如降低研發成本和提高效率，也為基因編輯、個性化診療、合成生物學等前沿領域帶來了新的機遇。低門檻的使用方式，也能夠吸引更多跨學科人才參與到生命科學研究中，推動該領域持續發展。

總而言之，HelixFold3作為一款國產的、性能卓越且易于使用的生物分子結構預測模型，有望成為生命科學領域的重要工具，加速科研進程，推動產業發展。其低門檻的特性將極大降低科研門檻，促進更多創新和突破。

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