權威期刊Cell Discovery新成果！上海交大洪亮團隊提出CPDiffusion模型，超低成本、全自動設計功能型蛋白質

AIGC動態歡迎閱讀

原標題：權威期刊Cell Discovery新成果！上海交大洪亮團隊提出CPDiffusion模型，超低成本、全自動設計功能型蛋白質
關鍵字：蛋白質,序列,活性,模型,解讀
文章來源：HyperAI超神經
內容字數：0字

內容摘要：

作者：周冰心，十九
編輯：李寶珠
上海交通大學洪亮團隊設計了一種擴散概率模型框架 CPDiffusion，該框架能夠以非常低的訓練成本、數據成本學習蛋白質的序列、結構與功能之間的隱含映射關系，從而生成多樣化的蛋白質序列。蛋白質是生命活動的主要執行者，其結構與功能之間的關系一直是生命科學領域研究的核心議題。近年來，隨著深度學習的興起，借助其強大的數據處理能力，讓模型學習蛋白質序列、結構及其功能之間的映射關系，設計出具備更高穩定性、更強結合親和力、更高酶活性的新型蛋白質，可以大幅提升蛋白質設計的效率，并有效降低其研發成本。
然而，現有方法通常需要在大規模數據集上訓練一個參數量極大的模型，難以推廣到同源序列稀少的特異蛋白上，往往也只能生成結構、功能相對簡單的蛋白質。此外，實驗驗證表明，設計出的蛋白一般活性較低，能夠超越野生型蛋白質的更是鳳毛麟角。
對此，上海交通大學自然科學研究院/物理與天文學院/張江高等研究院/藥學院洪亮課題組的助理研究員周冰心等人，設計了一種擴散概率模型框架 CPDiffusion，該框架結合蛋白質骨架結構、活性位點等多種生成條件，能夠以非常低的訓練成本、數據成本，學習蛋

原文鏈接：權威期刊Cell Discovery新成果！上海交大洪亮團隊提出CPDiffusion模型，超低成本、全自動設計功能型蛋白質