AI助力RNA病毒研究歷史性突破,中山大學(xué)等用深度學(xué)習(xí)模型,發(fā)現(xiàn)超過16萬種新病毒

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原標(biāo)題:AI助力RNA病毒研究歷史性突破,中山大學(xué)等用深度學(xué)習(xí)模型,發(fā)現(xiàn)超過16萬種新病毒
關(guān)鍵字:病毒,基因組,序列,多樣性,解讀
文章來源:HyperAI超神經(jīng)
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作者:田小幺
編輯:李寶珠
中山大學(xué)醫(yī)學(xué)院的施莽教授聯(lián)合浙江大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、香港城市大學(xué)、廣州大學(xué)、悉尼大學(xué)、阿里云飛天實(shí)驗(yàn)室等,提出了全新的深度學(xué)習(xí)模型 LucaProt,基于 Transformer 框架與大模型表征技術(shù),結(jié)合蛋白質(zhì)序列和內(nèi)在結(jié)構(gòu)性特征,在的測(cè)試數(shù)據(jù)集上表現(xiàn)優(yōu)異。2020 年初,新冠病毒的陰影迅速籠罩全球。在這場(chǎng)與時(shí)間的賽跑中,我們見證了無數(shù)英勇的個(gè)體和團(tuán)隊(duì)挺身而出,社會(huì)體系經(jīng)歷了一次次嚴(yán)峻考驗(yàn),也為全球的公共衛(wèi)生領(lǐng)域敲響了警鐘。
冠狀病毒之所以令人畏懼,很大程度上是因?yàn)樗鼘儆?RNA 病毒。這類病毒在復(fù)制過程中缺乏糾錯(cuò)機(jī)制,容易發(fā)生突變。這種突變能力不僅允許 RNA 病毒跨物種傳播,擴(kuò)大宿主范圍,還可能引發(fā)致病力的變化。原本對(duì)人類無害的病毒,一旦發(fā)生突變,就可能變得具有致病性,從而引發(fā)疾病。由于人類對(duì)這類突變病毒普遍缺乏免疫力,一旦病毒發(fā)生變異,就可能迅速引發(fā)大規(guī)模的疾病流行。
盡管病毒與人類健康密切相關(guān),但人類已知已確認(rèn)的病毒種類僅有 5,000 余種,可謂是冰山一角。傳統(tǒng) RNA 病毒鑒定方法高度依賴序列同源性比對(duì),即通過比較未知病毒與已知病
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