揭開基因組的秘密:Evo模型在Science封面展示分子到基因組的創(chuàng)新預(yù)測與生成能力
內(nèi)含教程詳解步驟
原標(biāo)題:搶先體驗Demo!基因組基礎(chǔ)模型Evo登Science封面,實現(xiàn)從分子到基因組尺度的預(yù)測與生成
文章來源:HyperAI超神經(jīng)
內(nèi)容字?jǐn)?shù):3217字
HyperAI超神經(jīng)教程上線Evo模型
根據(jù)作者李姝的介紹,HyperAI超神經(jīng)教程版塊現(xiàn)已上線一項名為「Evo:從分子到基因組規(guī)模的預(yù)測和生成」的內(nèi)容,旨在讓用戶快速體驗這一先進(jìn)的AI模型。Evo是一種基因組基礎(chǔ)模型,由斯坦福大學(xué)與Arc研究所的研究團(tuán)隊共同開發(fā),能夠在DNA、RNA和蛋白質(zhì)的多模態(tài)任務(wù)中實現(xiàn)零樣本預(yù)測和高精度生成。
研究背景與成果
Evo的相關(guān)研究以「Sequence modeling and design from molecular to genome scale with Evo」為題,已在Science雜志上發(fā)表。該模型使用了StripedHyena架構(gòu),經(jīng)過在包含8萬多個細(xì)菌和古細(xì)菌基因組以及數(shù)百萬個預(yù)測的噬菌體和質(zhì)粒序列的大型基因組數(shù)據(jù)集上進(jìn)行訓(xùn)練,覆蓋了300億個核苷酸t(yī)oken。Evo的參數(shù)規(guī)模達(dá)到70億,最大上下文長度可達(dá)131,072個token,具有生成超過1兆堿基的合理基因組架構(gòu)DNA序列的能力。
應(yīng)用前景
Evo的能力不僅為生命科學(xué)提供了新的理論支撐,還可能在基因編輯、藥物發(fā)現(xiàn)、疾病診斷和農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域帶來突破性成果。許多網(wǎng)友對Evo的發(fā)布表示震撼,并對其具體應(yīng)用充滿期待。
如何體驗Evo模型
用戶可以通過以下步驟來體驗Evo模型的強(qiáng)大功能:
- 登錄hyper.ai,選擇「Evo:從分子到基因組規(guī)模的預(yù)測和生成」教程。
- 點擊右上角的「克隆」將教程克隆至自己的容器中。
- 選擇算力,推薦選擇「NVIDIA RTX A6000」。
- 新用戶可以使用邀請鏈接注冊,獲得4小時RTX 4090和5小時CPU的免費時長。
- 確認(rèn)信息后,等待資源分配,點擊「打開工作空間」。
- 在Jupyter工作空間中,雙擊打開「README」文件,進(jìn)入Evo模型運行頁面。
模型操作與效果演示
進(jìn)入Evo模型運行頁面后,用戶可以按照需求調(diào)整輸入?yún)?shù)。默認(rèn)輸入為DNA堿基對(ACGT),可根據(jù)需要修改,生成不同的DNA序列。用戶在調(diào)整完參數(shù)后,選擇「重啟并運行所有單元格」,稍等片刻即可查看生成的序列。此外,Evo還可以分析生成的DNA序列,預(yù)測蛋白編碼基因,設(shè)計RNA系統(tǒng),并展示蛋白質(zhì)的折疊結(jié)構(gòu)。
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