CP2K官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一款著名的從頭算分子動(dòng)力學(xué)軟件

MPQC官網(wǎng)入口網(wǎng)址，大型并行量子化學(xué)軟件；支持密度泛函（DFT）

CPMD官網(wǎng)入口網(wǎng)址，密度泛函平面波贗勢(shì)代碼，一款用于分子動(dòng)力學(xué)從頭計(jì)算的開(kāi)源軟件

Blast官網(wǎng)入口網(wǎng)址，能夠?qū)崿F(xiàn)比較兩段核酸或者蛋白序列之間的同源性的功能

DOCK官網(wǎng)入口網(wǎng)址，Kuntz研究小組發(fā)展的分子對(duì)接程序，可能是目前應(yīng)用最為廣泛的分子對(duì)接程序之一

AUTODOCK官網(wǎng)入口網(wǎng)址，主要應(yīng)用于執(zhí)行配體—蛋白分子對(duì)接

TINKER官網(wǎng)入口網(wǎng)址，一般性分子動(dòng)力學(xué)軟件,對(duì)生物體系略有偏重，優(yōu)點(diǎn)支持多種模型

CFOUR官網(wǎng)入口網(wǎng)址，以做耦合簇見(jiàn)長(zhǎng)的從頭算程序，同時(shí)也支持HF、微擾、CI、QCI計(jì)算

GAMESS官網(wǎng)入口網(wǎng)址，從頭計(jì)算量子化學(xué)程序。可以從RHF，ROHF，UHF，GVB和MCSCF計(jì)算波函，其中一些使用CI和MP2修正

NWChem官網(wǎng)入口網(wǎng)址，使用標(biāo)準(zhǔn)量子力學(xué)方法描述電子波函數(shù)或密度，計(jì)算分子和周期性系統(tǒng)的特性，還可進(jìn)行經(jīng)典分子動(dòng)力學(xué)和自由能模擬

國(guó)家超算長(zhǎng)沙中心官網(wǎng)入口網(wǎng)址，天河1A，0.772Pflops，湖南大學(xué)運(yùn)營(yíng)，國(guó)防科大學(xué)提供計(jì)算設(shè)備和技術(shù)支持

國(guó)家超算濟(jì)南中心官網(wǎng)入口網(wǎng)址，神威·藍(lán)光，0.796Pflops,山東省計(jì)算中心承建

TOP500 超算排名官網(wǎng)入口網(wǎng)址，國(guó)際TOP500組織發(fā)布的，全球已安裝的超級(jí)計(jì)算機(jī)系統(tǒng)排名

用途廣泛的軟件包，一個(gè)高度通用的，進(jìn)行和分析粗粒度原子模型或珠簧模型的分子動(dòng)力學(xué)軟件包

基于密度泛含理論，采用贗勢(shì)和平面波基矢的方法來(lái)處理由電子和核所組成的體系

被廣泛承認(rèn)并應(yīng)用的分子動(dòng)力學(xué)模擬程序，用于生物大分子的模擬

半經(jīng)驗(yàn)計(jì)算和從頭計(jì)算使用最廣泛的量子化學(xué)軟件

高效能的計(jì)算仿真工具, 工程師能夠根據(jù)自行定義多種物理模型,應(yīng)用於各種不同的工程領(lǐng)域

針對(duì)超級(jí)計(jì)算機(jī)能效的排行榜

神威·太湖之光，93Pflops，科技部、江蘇省和無(wú)錫市三方共同投資建設(shè)

天河2A，61.4Pflops，由廣東省、廣州市、國(guó)防科大、中山大學(xué)共同建設(shè)

國(guó)家超級(jí)計(jì)算天津中心是2009年5月批準(zhǔn)成立的首家國(guó)家級(jí)超級(jí)計(jì)算中心，部署有2010年11月世界超級(jí)計(jì)算機(jī)TOP500排名第一的“天河一號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī)和“天河三號(hào)”原型機(jī)系統(tǒng)，構(gòu)建有超算中...

國(guó)家超級(jí)計(jì)算深圳中心（深圳云計(jì)算中心）系深圳市人民政府批準(zhǔn)成立的企業(yè)化管理事業(yè)單位，屬國(guó)家863計(jì)劃、廣東省和深圳市重大項(xiàng)目。主機(jī)系統(tǒng)2010年5月經(jīng)世界超級(jí)計(jì)算機(jī)組織實(shí)測(cè)確...

國(guó)家超級(jí)計(jì)算鄭州中心

曙光5000A，0.4Pflops，上海重要的信息技術(shù)基礎(chǔ)設(shè)施

深騰7000，2.3Pflops(0.7CPU+1.6GPU)，元”超級(jí)計(jì)算系統(tǒng)

面向?qū)ο蟮挠邢拊辔锢韴?chǎng)環(huán)境模擬軟件，主要用于解決多尺度非線性的地球科學(xué)和工程力學(xué)問(wèn)題

通過(guò)搜索蛋白質(zhì)或DNA數(shù)據(jù)庫(kù)，或通過(guò)識(shí)別序列中的局部重復(fù)，找到蛋白質(zhì)或DNA序列之間的局部或全局相似性區(qū)域

分子動(dòng)力學(xué)相關(guān)的一些計(jì)算和模擬工作

序列組裝程序

專門(mén)適用于海洋或者海岸工程